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术语表

术语 含义
barcode 用于标记样本、细胞或空间位置的短序列标签
UMI Unique Molecular Identifier,用于标记原始分子并减少 PCR 扩增偏差
counts reads 或 UMI 汇总后的计数矩阵
TPM Transcripts Per Million,常用于表达量展示
peak ATAC-seq 或 ChIP-seq 中 reads 富集的基因组区域
motif 转录因子偏好结合的短 DNA 序列模式
DMR Differentially Methylated Region,差异甲基化区域
ASV Amplicon Sequence Variant,扩增子分析中精确序列变体
clonotype 免疫组库中按 CDR3、V/J 基因等规则定义的克隆型
LD Linkage Disequilibrium,连锁不平衡
eQTL 影响基因表达水平的遗传位点
pseudo-bulk 将同一样本同一细胞类型的单细胞 counts 汇总后做样本级分析
batch effect 与生物问题无关但系统影响数据的批次差异
confounder 同时影响分组和结果、可能造成假关联的混杂因素
FDR False Discovery Rate,多重检验中的假发现率
alpha diversity 单个样本内部的微生物多样性
beta diversity 样本之间的微生物群落差异
PRS Polygenic Risk Score,多基因风险评分
colocalization 判断 GWAS 与 QTL 信号是否可能共享同一因果变异