Peter 的医学转化能力学习蓝图 · 执行版¶
本文件是目标书的执行压缩版。原始目标不是内容大纲，而是学完后 Peter 应该具备的能力；Codex 写作时必须从能力反推 atomic notes。
读者画像¶
- 植物生物学 PI。
- 5 年生信工程经验。
- 统计学到 GLM、混合模型、贝叶斯入门，能看懂 ELBO。
- 已掌握组学方法学的基本路线。
- 没有医学训练；人类疾病、临床术语、人类细胞信号通路从零起点补。
五层学习金字塔¶
| 层 | 目标 | 权重 | 写作判断 |
|---|---|---|---|
| L1 临床素养 | 听懂医生和临床论文 | 10% | 先打语言关，不直接跳组学 |
| L2 人类分子细胞生物学 | 画得出人类通路和药物位点 | 20% | 每条通路写正常功能、疾病劫持、药物、植物对照 |
| L3 疾病分子机制 | 形成癌种/疾病档案能力 | 25% | 肿瘤优先，疾病定义到治疗耐药全链条 |
| L4 疾病×组学交叉 | 把临床问题翻译为组学设计 | 30% | 每个交叉点写取样、技术挑战、分析特殊性、真实论文 |
| L5 课题设计模式 | 客户咨询 playbook | 15% | 形成可复用方案模板和失败模式 |
七个终极验收能力¶
- 首次医生会议：30 分钟内跟上术语、问出深入临床问题、给出 3 套候选方案。
- 课题方案书：3-5 页，能直接用于医院基金或国自然初稿。
- 文献深读复述：24 小时内读完高影响论文并给医生可执行反馈。
- 通路与机制对话：能白板画通路，讲药物位点、反馈、耐药和组学验证。
- 临床数据解读：能读 KM 曲线、Cox 表、forest plot，并指出样本量和模型风险。
- 组学策略推荐：治疗反应、耐药、异质性、微环境、早诊、预后六类问题有 standard playbook。
- 跨学科翻译：医生观察 → 分子假设 → 组学实验 → 临床意义，双向流畅切换。
写作硬约束¶
- 不假设医学知识：临床术语首次出现必须中英双标，并用一句话解释。
- 不假设分子细节：关键蛋白、通路和药物位点必须先解释。
- 不抄综述：每篇笔记必须有原始证据或官方规范作为来源。
- 标清共识与争议：尤其是疾病机制、预测标志物、替代终点和临床外推。
- 临床时效性：指南、批准药物、临床试验状态必须查最新，并标注查询日期。
- 中国语境：涉及监管、样本、患者群体差异和临床实践时，必须补中国特殊性。
- 图形优先真实来源：优先使用 Wikimedia Commons、官方机构、开放论文或原文 Figure 入口；避免纯汉字流程图替代真实结果图。
启动路线¶
Wave A：L1 全部启动 + L2 核心 8 条通路。
Wave B：L3 肿瘤优先，肺癌、乳腺癌、结直肠癌、血液肿瘤。
Wave C：L4 肿瘤 × scRNA/spatial/WES/TCR 等高频交叉点。
Wave D：免疫、心血管、神经、感染微生物组全面铺开。
Wave E：每月新文献和真实客户会议复盘。